江蘇中方基因生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
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人疾病異常新抗原(包括腫瘤癌抗原)人工智能分析系統(tǒng)能為患者發(fā)現(xiàn)疾病尤其是腫瘤相關(guān)的、有潛在新抗原(癌抗原)性質(zhì)的超長(zhǎng)蛋白,為患者免疫治療提供依據(jù)。該系統(tǒng)通過外顯子和轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序能準(zhǔn)確表征腫瘤細(xì)胞的DNA和RNA的技術(shù),構(gòu)建算法模型以更有效地處理這類高通量測(cè)序(NGS)的大數(shù)據(jù),包括利用多個(gè)計(jì)算機(jī)集群服務(wù)器節(jié)點(diǎn),使用分布式并行計(jì)算,快速將患者個(gè)體化的全基因轉(zhuǎn)錄子按不同閱讀讀框進(jìn)行翻譯,找出正常和異常蛋白序列。該分析系統(tǒng)使用人工智能深度學(xué)習(xí),在有監(jiān)督學(xué)習(xí)訓(xùn)練下,對(duì)比公共開發(fā)的標(biāo)準(zhǔn)蛋白數(shù)據(jù)庫(NCBI)和我們自主建立的三代(Pacbio)長(zhǎng)讀長(zhǎng)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,識(shí)別有潛在抗原性質(zhì)的異常超長(zhǎng)蛋白。分析這些異常超長(zhǎng)蛋白序列及MHC(主要組織相容性復(fù)合體)親和力。最后,通過體內(nèi)體外免疫學(xué)分析,挑選、驗(yàn)證并確認(rèn)新抗原(癌抗原)。為疾病(腫瘤)的免疫治療提供重要的參考依據(jù)。